小黑麥?zhǔn)怯尚←満秃邴溄?jīng)種間雜交和染色體加倍培育而成的一種新異源多倍體物種，具有草產(chǎn)量高和抗逆等特性，是重要的糧飼兼用作物。但是，小黑麥遺傳多樣性及控制重要農(nóng)藝性狀位點(diǎn)的遺傳機(jī)制尚不清楚，限制了小黑麥的育種進(jìn)程。中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研究所麥類作物分子育種學(xué)科組通過對(duì)收集到的1969 份小黑麥（×Triticosecale spp.）種質(zhì)資源進(jìn)行農(nóng)藝性狀評(píng)價(jià)，構(gòu)建了200份小黑麥自然群體，并利用GBS進(jìn)行了基因型分型。利用read mapping方法鑒定了小黑麥染色體的易位、倒位、缺失、附加等類型，建立了快速、準(zhǔn)確的染色體片段變異類型鑒定新方法，解決了傳統(tǒng)細(xì)胞學(xué)鑒定技術(shù)要求高和操作時(shí)間長(zhǎng)等問題。通過全基因組關(guān)聯(lián)分析鑒定到21個(gè)可靠的控制重要農(nóng)藝性狀的遺傳位點(diǎn)，并篩選到16個(gè)候選基因，為六倍體小黑麥結(jié)實(shí)率基因的克隆和分子設(shè)計(jì)育種奠定了基礎(chǔ)。

　　該研究結(jié)果以Genotyping-by-sequencing and genome-wide association study reveal genetic diversity and loci controlling agronomic traits in triticale為題發(fā)表在學(xué)術(shù)期刊Theoretical and Applied Genetics（中科院1區(qū)Top期刊，IF=5.699）。該研究得到青海省科技廳青年基金（2019-ZJ-982Q）項(xiàng)目資助。助理研究員曹東為論文第一作者，研究員劉寶龍為通訊作者。

　　論文鏈接：https://doi.org/10.1007/s00122-022-04064-5

圖1 基于read mapping鑒定小黑麥染色體片段變異類型